Το Μουσείο ιδρύθηκε τον Οκτώβριο του 1997, στα πρώτα δύο δωμάτια του πρώην γυναικωνίτη  της συναγωγής «Σαλώμ».

Ιδρυτής του μουσείου είναι ο Άρον Χασόν, Ροδίτης τρίτης γενιάς, δικηγόρος από το Λος Άντζελες που παρατήρησε την έλλειψη ενημέρωσης για τη μοναδική ιστορία της εβραϊκής κοινότητας.

Το μουσείο ξεκίνησε   σαν  φωτογραφική έκθεση  με φωτογραφίες που συγκεντρώθηκαν από τους Ροδίτες Εβραίους της Διασποράς, τεκμηριώνοντας  την προπολεμική  εβραϊκή ζωή στη Ρόδο.

Σταδιακά, με την ενεργοποίηση και την οικονομική συμβολή της Κοινότητας και  μεμονωμένων δωρητών, το μουσείο επεκτάθηκε σε όλους τους χώρους  του πρώην γυναικωνίτη.

Από τον Ιούνιο του 2002, με τη συνεργασία του Εβραϊκού Μουσείου της Ελλάδας, παρουσιάστηκε μια μόνιμη έκθεση. Ακολούθησαν πρόσθετες  ανακαινίσεις. Το 2006 το μουσείο άνοιξε εκ νέου με  περισσότερα  ενημερωτικά πάνελ και εκθέματα .

Τα  εκθέματα είναι δωρεές Ροδιτών της διασποράς προς το μουσείο και περιλαμβάνουν  θρησκευτικά αντικείμενα, οικιακά σκεύη, ιστορικά έγγραφα, θρησκευτικά βιβλία, κοστούμια κτλ.

Σήμερα, το μουσείο βρίσκεται υπό την αιγίδα της Εβραϊκής Κοινότητας της Ρόδου.

Το 2018, η Γερμανική Πρεσβεία Αθηνών ενέκρινε  χορηγία προς  το Εβραϊκό Μουσείο της Ρόδου. Σκοπός της χορηγίας ήταν η δημιουργία μιας εφαρμογής κινητού τηλεφώνου που θα προσφέρει στους επισκέπτες μας, μια οπτικοακουστική περιήγηση της συναγωγής και του μουσείου. Το έργο ολοκληρώθηκε στα τέλη του 2019. Από το 2020 οι επισκέπτες μας μπορούν να τη χρησιμοποιούν σε Android και iPhone κινητά.

Τον Νοέμβριο του 2019 γίναμε μέλη του Οργανισμού Ευρωπαϊκών Εβραϊκών Μουσείων (AEJM). Ελπίζουμε ότι η ένταξή μας θα μας ωφελήσει στο μέλλον όσον αφορά την τεχνική υποστήριξη, τη συντήρηση των εκθεμάτων και την παρουσίαση της έκθεσης, δεδομένου ότι έχουν την τεχνογνωσία.

Το μουσείο μας επιθυμεί να τονώσει και να ενισχύσει την γνωριμία, τη γνώση και την κατανόηση του ευρύτερου κοινού για τον εβραϊκό πολιτισμό, την κληρονομιά και την ιστορία, αλλά κυρίως των νέων.

Κατά τη διάρκεια του χειμώνα, προσφέρονται ξεναγήσεις στη συναγωγή και το μουσείο στους ντόπιους μαθητές και φοιτητές. Οργανώνονται  εκδηλώσεις για το Ολοκαύτωμα και παρουσιάσεις για την εβραϊκή θρησκεία. Υποστηρίζουμε τη διδασκαλία του Ολοκαυτώματος σε τοπικά σχολεία, παρέχοντας πληροφορίες, σχετικά ντοκιμαντέρ και πρόσβαση στη βιβλιοθήκη μας.

Είμαστε ανοιχτοί για επισκέψεις καθημερινά από τον Απρίλιο μέχρι τον Οκτώβριο, προσφέροντας επίσης, σε όποιον το επιθυμεί, ξεναγήσεις στη Συναγωγή, το Μουσείο και την εβραϊκή συνοικία. Δεχόμαστε πάνω  από 20.000 επισκέπτες κάθε χρόνο.

Για να πραγματοποιήσει κάποιος επίσκεψη  το υπόλοιπο της χρονιάς, απαιτείται  ραντεβού.